生命科学分野におけるナレッジグラフとオントロジーを知って・学んで・使う

「データ解析講習会：AJACS（あじゃっくす）」は、生命科学におけるデータ解析の入り口を提供します。

膨大かつ多様化するゲノム、タンパク質、臨床情報などがデータベースで次々に公開される現代、研究の現場ではこれらの情報を自在に扱えているでしょうか。
たとえば「実験で見出した変異がヒトでどの疾患と結び付き、モデル動物ではどのような表現型を示すのか」を調べようとすると、GenBank で配列を確認し、ClinVar で臨床的意義を確かめ、MGI でマウス表現型を探す――といった具合に複数のデータベースを行き来しながら異なる ID や用語を手作業で突き合わせる必要があり、新しい知見にたどり着くことは困難です。

この課題を解決するのが、関連するデータを結び付けるナレッジグラフと、その共通語彙にあたるオントロジーです。

本講習会では、公開ツール（TogoID、RDF Portal、PubCaseFinder ほか）を用いて、手元の実験結果を文献や公共 DB と紐付ける方法をご紹介します。さらに、大規模言語モデルを用いたデータ統合の取り組みなど、最新の事例もご紹介します。

生命科学分野で活用される情報技術を自身の研究に取り入れたい、自身で収集したデータを高度に管理したい・外部のデータと繋げたいなど、データを扱う上での先端の話題や実践的な使い方を知りたい・学びたいという方を対象とします。

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